藻蓝蛋白是从螺旋藻中分离出的一种深蓝色粉末，是螺旋藻中一种主要功能性蛋白质，含量占螺旋藻干基的20%。主要存在于蓝藻、红藻和隐藻中。藻蓝素通常也分为C-藻蓝素和R-藻蓝素，它既是一种蛋白质，又是一种极好的天然食用色素，同时又是良好的保健食品。它易溶于水，有荧光性，是美国FDA认可的天然蓝色色素。

藻蓝蛋白富含高质量的蛋白质及人体所需的8种氨基酸，是人体更容易识别和吸收的微量营养素，营养价值极高，所以被形象地誉为“食物钻石”。

藻蓝蛋白可以帮助调节、合成人体所需要的代谢酶，对抑制癌细胞生长，促进细胞再生，保养卵巢，增强免疫系统具有重要作用。它作为唯一兼具清除超氧阴离子、羟自由基和过氧化物的天然产物，其抗氧化能力远超SOD和维C，能有效对抗氧化损伤。藻蓝蛋白对多种重大疾病、慢性病及疑难杂症均有显著效果，国际研究已证实其40多种功效，是一种罕见且高效的天然营养保健品。

藻蓝蛋白已被证明能抑制癌症细胞扩展。大量研究表明，藻蓝蛋白对多种肿瘤具有抑制作用，如乳腺癌、肝癌等。能够抑制人结肠癌SW480细胞增殖、诱导人喉癌H EP-2细胞凋亡、抑制肺癌LTEP-a-2细胞生长、抑制肺癌A549细胞 、诱导非小细胞肺癌H 1299细胞凋亡且抑制该细胞生长和迁移等。科学家研究发现，藻蓝蛋白有明显抑制癌细胞、增强机体免疫力的功能，可以制成抗肿瘤的辅助治疗药物，可联合光动力疗法以及联合药物等用于癌症治疗。

藻蓝蛋白有抗氧化活性，能清除受损的神经细胞自由基，避免DNA氧化损伤，从而防止自由基清除和产生引起的代谢紊乱。自由基参与很多疾病的发生过程，包括: 炎症，动脉粥样硬化，癌症，再灌注造成的损害及氧化胁迫引起的其他机能障碍等。

纯化的藻蓝蛋白藻蓝蛋白能够通过其免疫调节活性降低过敏性反应。具有免疫调节活性、抗衰老、抗辐射、抗疲劳、促进细胞生长以及神经保护等生物学功能。

藻蓝蛋白通过其抗氧化和清除自由基的能力，能够减轻炎症反应，保护组织免受损害。

藻蓝蛋白是水溶性色素，无毒，纯蓝，清亮，可作为食品着色剂、化妆品的添加剂。我国规定藻蓝蛋白作为食品着色剂，可用于果冻、糖果、奶酪、果汁( 味) 饮料类、雪糕和冰棍等食品中。

藻蓝蛋白作为一种重要的生理活性成分，具有抗癌、抗氧化、治疗脑缺血损伤、提高机体免疫力等多种生理功能，可制成药品用于医疗保健。目前国外已成功研制出多种藻蓝蛋白复合药品，具有改善贫血、提高血色素和提高免疫、抗疾病功能的功能。

藻蓝蛋白蓝色并有荧光，可以制成荧光试剂、荧光探针、荧光示踪物质等产品，作为光敏剂用于临床医学诊断、免疫化学及生物工程等领域中。